故事发生在未来世界之中，彼时，一种凭空出现的名叫“ ”的生命体让人类的命运走到了濒临灭绝的边缘。就在此时，世界各国联合起来发明了能够同 抗衡的武器，而只用这些武器的少女面则被称之为莉莉。　

天使珈百璃（富田美忧 配音）以天使学校第一名的优异成绩毕业，决定降临人间体会一下凡间的多彩生活。在珈百璃的未来规划中，她将要一边做善事给人类带来幸福一遍完成在人类学校中的课业，然而某一日，珈百璃无意间

由“国家组织 ”新设的特殊技能训练校“美滨学园”……因各种原因失去归所的少女们被交付的是，枪与实弹。使用手枪的玲奈、擅长狙击的桐花、炸弹与信息处理的克莉丝、负责谍报活动的忍者邑沙季。她们每天都以